Отдел молекулярной биофизики

RU ENG

Основные направления исследований

Конформационные и фазовые переходы в комплексах нуклеиновых кислот с ионами металлов

Основные направления исследований:

  • определение спектральных и термодинамических свойств металлокомплексов нуклеиновых кислот (НК), образующих канонические и неканонические спирали;
  • исследование фазовых и конформационных переходов в этом классе соединений.
  • ab initio расчеты энергетических характеристик, молекулярной и электронной структуры фрагментов металлизированной ДНК.

Основные результаты:

  • построены диаграммы конформационного равновесия в комплексах ионов Ni2+ и Cd2+ с двух- и трёхцепочечным полинуклеотидами, состоящими из аденина и урацила;
  • установлена физическая природа различного влияния ионов Mg2+ и Ni2+ на температуру перехода двухнитевого полинуклеотида (полиA•полиU) в трёхнитевую конформацию (полиA•2полиU);
  • обнаружен фазовый переход второго рода в гетерогенной ДНК в условиях равной стабильности АТ- и ГЦ-пар;
  • показано, что энергетически более выгодным является замещение иминопротона внутри комплементарной пары оснований НК ионом цинка

Сотрудники, работающие по теме:
профессор, д.ф.м.-н., главн. научн. сотр. Благой Ю.П.; профессор, д.ф.м.-н., вед. научн. сотр. Сорокин В.А.; д.ф.м.-н., с.н.с. Рубин Ю.В.; вед. инж. Валеев В.А.; вед. инж. Усенко Е.Л.

Основные публикации последних лет:

  1. V.A. Sorokin, E.L.Usenko and V.A. Valeev
    “Mg2+ and Ni2+ ion Effects on phase transitions in AU and A2U under conditions close to physiological ones”
    Int. Fed. Med. Biol. Engr. Proc.- 2008.- 20.- Р. 628-631.
  2. Сорокин В.А., Валеев В.А., Усенко Е.Л.
    Влияние ионов Ni2+ на конформационное равновесие полинуклеотидов: полиA•полиU, полиА и полиU в условиях, близких к физиологическим
    Биополимеры и клетка.- 2008.- 24.- №2.- С.158-170.
  3. Sorokin V. A., Valeev V. A., Usenko E. L., Andrus E. A., and Blagoi Yu. P.
    The Nature of Different Influence of Cd2+ Ions on the Conformational Equilibrium of Triple-Stranded Polyribonucleotides Poly(U)•Poly(A)•Poly(U) and Poly(I)•Poly(A)•Poly(I) in Aqueous Solutions
    Biophysics.- 2007.- 52.- №6.- P. 545-557.
  4. Сорокин В.А., Валеев В.А., Усенко Е.Л., Благой Ю.П.
    Влияние ионов Cd2+ на конформационное равновесие трёхцепочечного полинуклеотида полиU?полиA?полиU в условиях, близких к физиологическим
    Биополимеры и клетка.- 2007.- 23.- №5.- С.433-440.
  5. Blagoi Yu., Zozulya V., Egupov S., Onishchenko V., Gladchenko G.
    Thermodynamic analysis of conformational transitions in oligonucleotide complexes in presence of Na+ and Mg2+ ions, using “Staggering Zipper” model
    Biopolymers.- 2007.- 86.- N1.- P.32-40.
  6. Blagoi Yu.P., Gladchenko G.O., Nafie L.A., Freedman T.B., Sorokin V.A., Valeev V.A., He Ya.
    Phase equilibrium in poly(rA)•poly(rU) complexes with Cd2+ and Mg2+ ions, studied by ultraviolet, infrared, and vibrational circular dichroism spectroscopy
    Biopolymers.- 2005.- 78.- P. 275-286.
  7. V.A Sorokin, V.A. Valeev, G.O. Gladchenko , M.V. Degtiar, V.A. Karachevtsev, Yu.P. Blagoi.
    Mg2+ ion effect on conformational equilibrium of polyA•2polyU and polyA•polyU in aqueous solutions
    Int. J. Biol. Macromol. - 2003 - v.31. - p.223-233
  8. Sorokin V.A., Valeev V.A., Gladchenko G.O., Degtyar M.V., Blagoi Yu.P.
    Ni2+ Ion Effect on Conformations of Single-, Double- and Three-Stranded Homopolynucleotides Containing Adenine and Uracil
    Macromol. Biosci.- 2001. - N 5. - p. 191 – 203
  9. Рубин Ю.В., Белоус Л.Ф., Якуба А.А.
    Молекулярная и электронная структуры фрагмента металлизированной ДНК - пары аденин-тимин с ионом цинка
    'Доповiдi НАН Украiни' 2008, 5, с.186-191