Отдел молекулярной биофизики

Основные направления исследований:

• определение спектральных и термодинамических свойств металлокомплексов нуклеиновых кислот (НК), образующих канонические и неканонические спирали;
• исследование фазовых и конформационных переходов в этом классе соединений.
• ab initio расчеты энергетических характеристик, молекулярной и электронной структуры фрагментов металлизированной ДНК.

Основные результаты:

• построены диаграммы конформационного равновесия в комплексах ионов Ni²⁺ и Cd²⁺ с двух- и трёхцепочечным полинуклеотидами, состоящими из аденина и урацила;
• установлена физическая природа различного влияния ионов Mg²⁺ и Ni²⁺ на температуру перехода двухнитевого полинуклеотида (полиA•полиU) в трёхнитевую конформацию (полиA•2полиU);
• обнаружен фазовый переход второго рода в гетерогенной ДНК в условиях равной стабильности АТ- и ГЦ-пар;
• показано, что энергетически более выгодным является замещение иминопротона внутри комплементарной пары оснований НК ионом цинка

Сотрудники, работающие по теме:
профессор, д.ф.м.-н., главн. научн. сотр. Благой Ю.П.; профессор, д.ф.м.-н., вед. научн. сотр. Сорокин В.А.; д.ф.м.-н., с.н.с. Рубин Ю.В.; вед. инж. Валеев В.А.; вед. инж. Усенко Е.Л.

Основные публикации последних лет:

1. V.A. Sorokin, E.L.Usenko and V.A. Valeev
   “Mg²⁺ and Ni²⁺ ion Effects on phase transitions in AU and A2U under conditions close to physiological ones”
   Int. Fed. Med. Biol. Engr. Proc.- 2008.- 20.- Р. 628-631.
2. Сорокин В.А., Валеев В.А., Усенко Е.Л.
   Влияние ионов Ni²⁺ на конформационное равновесие полинуклеотидов: полиA•полиU, полиА и полиU в условиях, близких к физиологическим
   Биополимеры и клетка.- 2008.- 24.- №2.- С.158-170.
3. Sorokin V. A., Valeev V. A., Usenko E. L., Andrus E. A., and Blagoi Yu. P.
   The Nature of Different Influence of Cd²⁺ Ions on the Conformational Equilibrium of Triple-Stranded Polyribonucleotides Poly(U)•Poly(A)•Poly(U) and Poly(I)•Poly(A)•Poly(I) in Aqueous Solutions
   Biophysics.- 2007.- 52.- №6.- P. 545-557.
4. Сорокин В.А., Валеев В.А., Усенко Е.Л., Благой Ю.П.
   Влияние ионов Cd²⁺ на конформационное равновесие трёхцепочечного полинуклеотида полиU?полиA?полиU в условиях, близких к физиологическим
   Биополимеры и клетка.- 2007.- 23.- №5.- С.433-440.
5. Blagoi Yu., Zozulya V., Egupov S., Onishchenko V., Gladchenko G.
   Thermodynamic analysis of conformational transitions in oligonucleotide complexes in presence of Na⁺ and Mg²⁺ ions, using “Staggering Zipper” model
   Biopolymers.- 2007.- 86.- N1.- P.32-40.
6. Blagoi Yu.P., Gladchenko G.O., Nafie L.A., Freedman T.B., Sorokin V.A., Valeev V.A., He Ya.
   Phase equilibrium in poly(rA)•poly(rU) complexes with Cd²⁺ and Mg²⁺ ions, studied by ultraviolet, infrared, and vibrational circular dichroism spectroscopy
   Biopolymers.- 2005.- 78.- P. 275-286.
7. V.A Sorokin, V.A. Valeev, G.O. Gladchenko , M.V. Degtiar, V.A. Karachevtsev, Yu.P. Blagoi.
   Mg²⁺ ion effect on conformational equilibrium of polyA•2polyU and polyA•polyU in aqueous solutions
   Int. J. Biol. Macromol. - 2003 - v.31. - p.223-233
8. Sorokin V.A., Valeev V.A., Gladchenko G.O., Degtyar M.V., Blagoi Yu.P.
   Ni²⁺ Ion Effect on Conformations of Single-, Double- and Three-Stranded Homopolynucleotides Containing Adenine and Uracil
   Macromol. Biosci.- 2001. - N 5. - p. 191 – 203
9. Рубин Ю.В., Белоус Л.Ф., Якуба А.А.
   Молекулярная и электронная структуры фрагмента металлизированной ДНК - пары аденин-тимин с ионом цинка
   'Доповiдi НАН Украiни' 2008, 5, с.186-191